В целях повышения эффективности совместной деятельности Счетной палаты Города Томска и следственного управления Следственного комитета Российской Федерации по Томской области 18 ноября 2019 года заключено соглашение об их взаимодействии.
Руководители Счетной палаты и следственного управления отметили важность сотрудничества контрольно-счетных и следственных органов при выявлении правонарушений в сфере бюджетных правоотношений, в том числе в рамках реализации национальных проектов на территории муниципального образования «Город Томск».